下胚胎期有2条原始生殖管道(医学上称为副中肾管)，发育为女性生殖器官：子宫、输卵管、卵巢、阴道。但由于某些原因2条生殖管道未能向身体中线横向伸延会合形成子宫，或会合不久即停止发育而形成无子宫或子宫发育不全，因而无月经来潮。

(2)性染色体或性腺发育异常疾病也常常是原发性闭经产生的原因。如先天性卵巢发育不全(又称特纳氏综合征)、单纯性腺发育不全。

(3)某些性激素分泌异常疾病，如先天性肾上腺皮质增生症，也可引起原发性闭经。

(4)少数情况下，原发性闭经还要除外结核、妊娠，以及由于下生殖道闭锁(处女膜、阴道闭锁)等引起假性闭经。

少女至18岁还未行经不要怕羞应去医院检查，医生会根据其身体生长发育、乳房、生殖器官发育情况做一些必要的检查，如B超、性染色体测定、腹腔镜检查观察性腺发育情况等来确定闭经的原因，根据不同病因可以给予必要的治疗。如先天子宫发育不全可以口服小剂量己烯雌酚以促进发育，不能纠正的可给予雌、孕激素行替代治疗形成人工月经。对于先天发育畸形如下生殖道闭锁、无阴道、外阴畸形等则可予手术矫形。